완벽한 격자구조(Pristine Structure) 확보 방법
1. 주요 데이터베이스 (DB)
Materials Project (MP)
가장 추천하는 소스입니다. 수만 개의 화합물에 대해 최적화된 CIF 파일과 에너지를 제공합니다. (Open Access)
ICSD
무기 결정 구조의 표준입니다. 실험 데이터 위주라 신뢰도가 매우 높지만 보통 유료/기관 로그인이 필요합니다.
Crystallography Open DB (COD)
전 세계 연구자들이 기탁한 실험 구조 데이터가 모인 오픈 데이터베이스입니다.
AFLOW / OQMD
대규모 DFT 계산 결과를 보유하고 있어 데이터 기반 연구(Informatics)에 유리합니다.
2. 라이브러리를 이용한 생성
파이썬 라이브러리인 ASE (Atomic Simulation Environment)나 Pymatgen을 사용하면 코드로 직접 구조를 생성할 수 있습니다.
- 단순 결정(FCC, BCC 등)은 내장 함수로 즉시 생성 가능
- 단위격자(Unit cell)를 확장하여 대형 슈퍼셀(Supercell) 제작 용이
3. 구조 확보 후 필수 처리 과정
1
데이터 추출: DB에서 CIF 또는 POSCAR 파일 다운로드
2
포맷 변환: 시뮬레이션 툴(VASP, LAMMPS 등)에 맞는 파일로 변환
3
구조 최적화(Relaxation): 사용할 MLIP 모델을 이용해 에너지가 가장 낮은 안정화된 위치 계산
4
Pristine 에너지 확정: 최적화 완료 후 출력된 에너지를 Epristine으로 사용
* 주의: 외부에서 가져온 구조는 반드시 자신의 계산 환경(포텐셜 종류, Cutoff 등)에서 다시 최적화해야 오류를 방지할 수 있습니다.
